Plusieurs moyens de rendre dynamique le son de l’orgue sont rapidement généralisés : le tremblant, connu dans les pays du nord depuis le XVIIe siècle et les jeux ondulants, goûtés au sud depuis le XVIe siècle. La boîte expressive, qui permet d’amplifier ou diminuer le son, répandue en Espagne au XVIIIe siècle, est développée en France par Cavaillé-Coll et ses successeurs sous le nom de récit.

La modification la plus profonde que subit l’orgue à cette époque porte sur sa composition, c’est à dire le choix des jeux d’un instrument.

Remaniement du catalogue des jeux en usage, répartition entre  divers claviers, multiplication des timbres comme « viole de gambe », « cor anglais », « clarinette », « flûte harmonique », etc. En outre, le XIXe siècle élimine ce qu’il appelle les « sifflets » : jeux aigus sans reprises et cymbales, et les fournitures sont rendues méconnaissables.

Dans le domaine technique, les traditions sont abandonnées. Le sommier à registres est remplacé par le sommier à pistons. La traction mécanique à l’origine est supplantée par une traction entièrement pneumatique, transmettant les mouvements du clavier aux tuyaux non plus au moyen de vergettes et de pilotes, mais par de l’air comprimé.